Die Suspension muss regelmäßig umgewälzt werden, zum einen, um neues Material mit den vorhandenen Bakterien zu impfen und zum anderen um die Bildung von Schwimm- und Sinkschichten zu verhindern. Außerdem sorgt das Rühren für eine gleichmäßige Temperatur und die Ausgasung aus der Flüssigkeit. Die am häufigsten eingesetzten Rührgeräte sind Axialrührwerke, Paddelrührwerke, Haspelrührwerke, Tauchmotorpropellerrührwerke, Stabmixer, Langachsrührwerke.
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